明朝天启年间,日本将军小泽正雄在争夺幕府大将的政斗中失势,率领残部数千之众,逃到我国东南沿海,结集海盗,为祸中华。其时,明朝皇帝年幼,大太监王其专政,王其妄图谋朝篡位,与倭寇相互勾结,残害忠臣,毁我朝柱。百姓生活在水火之中,大明江山面临内忧外患,岌岌可危。
故事的主角徐子豪乃京都总兵徐超之子,从小是大明皇帝的玩伴。他天资聪慧,机智多端,但贪图玩乐不务正业。由于徐子豪的父亲徐超一直在维护大明朝纲,与奸臣王其积下仇怨,王其设计陷害徐超勾结倭寇,将徐超满门抄斩,只有徐子豪被少林高僧所救逃出生天。
在公主朱若琴的鼓励和陪伴下,徐子豪逃到少林寺想练就一身武艺,报仇雪恨。少林方丈得知徐子豪学武为了报仇,本不愿接纳,但同情徐子豪遭遇,加上徐子豪天资独具,拥有过目不忘的能力,于是安排徐子豪做了一名藏经阁的小小武僧。
方丈将徐子豪留在寺里,一方面是想保护他,但更深考虑是希望让他在佛理中渐渐洗涤充满仇恨的内心,激发他过人的天赋,从而发挥在更重要的场合。徐子豪平时只能接触到和武术无关的佛经,想要学武的他心急如焚。机缘巧合,他终于看到了第一本武术经书《少林迷踪拳经》,他偷偷练习迷踪拳法,还打退了倭寇派来